提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
科学的温度 | 布洛芬助人无数,发明人却分文未赚?******
文案:甘甜 绘画:刘庆一(实习)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() 视觉焦点冉莹颖挺三胎孕肚主持节目 浓妆挡不住一脸疲态啊 问道3799浮生若梦至尊礼包
推荐阅读 彩神ap赔率国庆北京首贼大兴落网 身藏6部手机数张银行卡 2024-06-01 彩神ap计划群韩寒谈与吴京沈腾一起反盗版:我们是受害者联盟 2024-05-02 彩神ap注册网美军叫嚣将增加穿越台湾海峡频率 2024-09-03 彩神ap娱乐里弗斯和快船签下长约 他带领球队死磕卫冕冠军 2024-01-28 彩神ap官网网址 中国首个星际2世界冠军因病去世,他曾一人力压韩美,黄旭东悼念! 2024-05-04 彩神ap手机版APP《狂飙》中高启强得的“干眼症”,真是绝症吗 2024-11-06 彩神ap软件上戏女学生被外国老师遗弃携子闹场 官方回应:即兴表演 2024-05-06 彩神ap客户端外媒关注:中国钢架雪车选手头盔“古风浓” 2023-12-31 彩神ap返点纪检组长收受“九五至尊”香烟等礼品 被免职 2024-11-07 彩神ap下载法国多地后悔为巴黎圣母院捐款 撤销捐款承诺 2024-05-23 彩神apAPP张丹峰风波后洪欣首现身 全程带笑 2024-10-29 彩神ap开奖结果 博尔顿回应朝鲜开200万美元账单:美国承诺了,但没付一分钱 2024-10-17 彩神ap注册 长大后才懂您当时为啥总护着我 2024-05-26 彩神ap骗局又失误!德赫亚毁了马塔的生日趴 2024-05-07 彩神ap登录四闺蜜首秀小S最显老? 2024-06-09 彩神ap官网平台秦岭别墅拆了 它的支脉骊山又隐现别墅群 2024-08-26 彩神ap走势图朝阳学校文化节启动 年底将进行集中评审 2024-03-21 彩神ap代理戒赌吧老哥们,后来都怎样了 2024-10-07 彩神ap技巧就差一块钱,凭啥他是贫困户? 2024-10-02 彩神ap邀请码 “吴谢宇弑母案”的反思:德育、心理健康教育迫在眉睫 2023-12-26 彩神ap规则南非洪水过后垃圾“占领”德班港 触.. 2024-02-01 彩神ap漏洞光明网等承办2022年第四季度“中国好人榜”发布活动 2024-11-04 彩神ap必赚方案 新一代加价王?雷克萨斯LM 2024-05-06 彩神ap计划发小花30万装修90平新房 北欧现代混搭有点土 2024-05-20 加载更多 彩神ap地图 |